如何更好的觀察到乳腺癌

得克薩斯大學安德森分校癌癥中心的研究人員領導的一個小組克服了單細胞DNA(scDNA)測序的先前技術挑戰(zhàn)，開發(fā)了一種以單分子分辨率進行scDNA測序的新方法。這項技術*揭示了三陰性乳腺癌在染色體不穩(wěn)定的最初爆發(fā)后經(jīng)歷了連續(xù)的基因拷貝數(shù)變化。

這項發(fā)現(xiàn)發(fā)表在《自然》雜志上，為測序數(shù)百種癌細胞提供了一種準確而有效的新方法，同時也為癌癥的發(fā)展提供了新穎的見解。這些見解可以解釋為什么治療并不總是有效的，以及為什么研究人員不能在實驗室中產(chǎn)生同質(zhì)的細胞培養(yǎng)物。

與我們在單細胞DNA測序中的第-一種方法相比，這代表了顯著的進步，其通量，準確性和易用性大大提高?，F(xiàn)在，我們能夠以前所-未有的方式解決腫瘤細胞群體內(nèi)拷貝數(shù)的微小差異。”

Nicholas Navin博士，高級作者，遺傳與生物信息學與計算生物學副教授

這項新技術被稱為“聲細胞標簽化(ACT)”，首先是通過熒光激活的細胞分選從數(shù)千個細胞中分離出單個細胞核。然后通過三步化學過程將每個細胞中的DNA切割成精-確的片段，添加通用接頭并結(jié)合條形碼以進行下一代測序。

通過這種改進的方法，可以對有限數(shù)量的細胞中的DNA進行測序，研究人員試圖回答有關癌癥進化的一個常設問題。納文(Navin)的研究小組先前確定，三陰性乳腺癌會經(jīng)歷標點進化，在染色體不穩(wěn)定的初始爆發(fā)中獲得拷貝數(shù)變化，但是未知癌細胞在該事件后是否繼續(xù)積累變化。

化學過程是通過聲學液體傳輸技術執(zhí)行的，該技術使用聲波快速有效地傳輸微量液體。Navin解釋說，早期的scDNA測序方法從開始到結(jié)束需要三天的時間，而新的方法可以在三小時內(nèi)完成。